Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BBS2Q9BXC9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBS2Q9BXC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BBS2Q9BXC9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BBS2Q9BXC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms