Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWM7

SFXN3, Sideroflexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN3Q9BWM7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFXN3Q9BWM7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN3Q9BWM7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFXN3Q9BWM7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFXN3Q9BWM7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms