Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM2Q9BVW6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM2Q9BVW6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM2Q9BVW6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms