Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC2P3Q9BVR0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC2P3Q9BVR0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC2P3Q9BVR0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HERC2P3Q9BVR0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERC2P3Q9BVR0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC2P3Q9BVR0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC2P3Q9BVR0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC2P3Q9BVR0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC2P3Q9BVR0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC2P3Q9BVR0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC2P3Q9BVR0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERC2P3Q9BVR0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERC2P3Q9BVR0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC2P3Q9BVR0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC2P3Q9BVR0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC2P3Q9BVR0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC2P3Q9BVR0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC2P3Q9BVR0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms