Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIKE1Q9BRV8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIKE1Q9BRV8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIKE1Q9BRV8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIKE1Q9BRV8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms