Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR0

ZKSCAN3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3Q9BRR0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZKSCAN3Q9BRR0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZKSCAN3Q9BRR0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZKSCAN3Q9BRR0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN3Q9BRR0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZKSCAN3Q9BRR0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
ZKSCAN3Q9BRR0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZKSCAN3Q9BRR0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZKSCAN3Q9BRR0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZKSCAN3Q9BRR0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZKSCAN3Q9BRR0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZKSCAN3Q9BRR0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms