Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LPIN3Q9BQK8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPIN3Q9BQK8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LPIN3Q9BQK8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LPIN3Q9BQK8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms