Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDRT15Q96T59 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CDRT15Q96T59 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDRT15Q96T59 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDRT15Q96T59 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms