Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMC6Q96SB8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC6Q96SB8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC6Q96SB8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMC6Q96SB8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms