Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNL2Q96S94 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL2Q96S94 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNL2Q96S94 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms