Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CSRNP1Q96S65 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CSRNP1Q96S65 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CSRNP1Q96S65 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms