Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCCC1Q96RQ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCCC1Q96RQ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCC1Q96RQ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms