Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP4Q96MN2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP4Q96MN2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP4Q96MN2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP4Q96MN2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP4Q96MN2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP4Q96MN2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP4Q96MN2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP4Q96MN2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP4Q96MN2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP4Q96MN2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP4Q96MN2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP4Q96MN2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP4Q96MN2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP4Q96MN2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms