Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK4Q96L34 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARK4Q96L34 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARK4Q96L34 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARK4Q96L34 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms