Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MARK4Q96L34 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MARK4Q96L34 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MARK4Q96L34 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MARK4Q96L34 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MARK4Q96L34 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
MARK4Q96L34 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MARK4Q96L34 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MARK4Q96L34 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MARK4Q96L34 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MARK4Q96L34 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MARK4Q96L34 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MARK4Q96L34 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MARK4Q96L34 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MARK4Q96L34 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MARK4Q96L34 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MARK4Q96L34 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MARK4Q96L34 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MARK4Q96L34 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MARK4Q96L34 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MARK4Q96L34 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MARK4Q96L34 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MARK4Q96L34 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MARK4Q96L34 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MARK4Q96L34 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MARK4Q96L34 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MARK4Q96L34 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MARK4Q96L34 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MARK4Q96L34 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MARK4Q96L34 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MARK4Q96L34 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MARK4Q96L34 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MARK4Q96L34 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MARK4Q96L34 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MARK4Q96L34 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MARK4Q96L34 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MARK4Q96L34 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MARK4Q96L34 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MARK4Q96L34 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MARK4Q96L34 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MARK4Q96L34 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MARK4Q96L34 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MARK4Q96L34 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MARK4Q96L34 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MARK4Q96L34 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MARK4Q96L34 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MARK4Q96L34 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MARK4Q96L34 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MARK4Q96L34 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MARK4Q96L34 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MARK4Q96L34 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MARK4Q96L34 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARK4Q96L34 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MARK4Q96L34 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARK4Q96L34 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARK4Q96L34 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARK4Q96L34 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MARK4Q96L34 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARK4Q96L34 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MARK4Q96L34 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARK4Q96L34 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MARK4Q96L34 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MARK4Q96L34 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MARK4Q96L34 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARK4Q96L34 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARK4Q96L34 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARK4Q96L34 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARK4Q96L34 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARK4Q96L34 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARK4Q96L34 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARK4Q96L34 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARK4Q96L34 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MARK4Q96L34 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MARK4Q96L34 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARK4Q96L34 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARK4Q96L34 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MARK4Q96L34 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MARK4Q96L34 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MARK4Q96L34 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARK4Q96L34 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MARK4Q96L34 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MARK4Q96L34 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MARK4Q96L34 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARK4Q96L34 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARK4Q96L34 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARK4Q96L34 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARK4Q96L34 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARK4Q96L34 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARK4Q96L34 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARK4Q96L34 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARK4Q96L34 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARK4Q96L34 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MARK4Q96L34 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARK4Q96L34 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARK4Q96L34 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MARK4Q96L34 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARK4Q96L34 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARK4Q96L34 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARK4Q96L34 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARK4Q96L34 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms