Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIC2Q96JB3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIC2Q96JB3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIC2Q96JB3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms