Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRMT2BQ96GJ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRMT2BQ96GJ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRMT2BQ96GJ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms