Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PGBD4Q96DM1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGBD4Q96DM1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGBD4Q96DM1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PGBD4Q96DM1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PGBD4Q96DM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGBD4Q96DM1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms