Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FUBP1Q96AE4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FUBP1Q96AE4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FUBP1Q96AE4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FUBP1Q96AE4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FUBP1Q96AE4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FUBP1Q96AE4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FUBP1Q96AE4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FUBP1Q96AE4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FUBP1Q96AE4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms