Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA10Q969M2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA10Q969M2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA10Q969M2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA10Q969M2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA10Q969M2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA10Q969M2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJA10Q969M2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA10Q969M2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJA10Q969M2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA10Q969M2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA10Q969M2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA10Q969M2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA10Q969M2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms