Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIFAP3Q92845 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIFAP3Q92845 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFAP3Q92845 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIFAP3Q92845 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIFAP3Q92845 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms