Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC7Q8WUI4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC7Q8WUI4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDAC7Q8WUI4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC7Q8WUI4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.6 ms