Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG1Q8WTW3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COG1Q8WTW3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG1Q8WTW3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
COG1Q8WTW3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COG1Q8WTW3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG1Q8WTW3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG1Q8WTW3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms