Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BEST2Q8NFU1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEST2Q8NFU1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEST2Q8NFU1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BEST2Q8NFU1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms