Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD9Q8NE22 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD9Q8NE22 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD9Q8NE22 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD9Q8NE22 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms