Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC38A9Q8NBW4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A9Q8NBW4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A9Q8NBW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC38A9Q8NBW4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A9Q8NBW4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms