Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STAG2Q8N3U4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
STAG2Q8N3U4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STAG2Q8N3U4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
STAG2Q8N3U4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
STAG2Q8N3U4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STAG2Q8N3U4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG2Q8N3U4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
STAG2Q8N3U4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG2Q8N3U4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms