Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms