Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CSAG1Q6PB30 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CSAG1Q6PB30 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CSAG1Q6PB30 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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