Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
H3F3CQ6NXT2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3F3CQ6NXT2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms