Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00242Q5T6M2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00242Q5T6M2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00242Q5T6M2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms