Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF19Q5SWL8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF19Q5SWL8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF19Q5SWL8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF19Q5SWL8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms