Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM23BQ5SRD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM23BQ5SRD1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM23BQ5SRD1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM23BQ5SRD1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM23BQ5SRD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms