Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAX1Q5SQQ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAX1Q5SQQ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VAX1Q5SQQ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAX1Q5SQQ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms