Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALFQ53S48 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALFQ53S48 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALFQ53S48 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALFQ53S48 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALFQ53S48 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALFQ53S48 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALFQ53S48 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALFQ53S48 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ALFQ53S48 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALFQ53S48 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALFQ53S48 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.9 ms