Protein–RNA interactions for Protein: Q53RY4

KRTCAP3, Keratinocyte-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTCAP3Q53RY4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRTCAP3Q53RY4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRTCAP3Q53RY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP3Q53RY4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP3Q53RY4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms