Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM259Q4ZIN3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM259Q4ZIN3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.9 ms