Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRY1Q16526 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRY1Q16526 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRY1Q16526 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms