Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPTX1Q15818 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPTX1Q15818 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPTX1Q15818 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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