Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC41Q15345 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRC41Q15345 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRC41Q15345 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC41Q15345 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms