Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SSPNQ14714 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSPNQ14714 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSPNQ14714 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSPNQ14714 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSPNQ14714 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSPNQ14714 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSPNQ14714 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SSPNQ14714 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSPNQ14714 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSPNQ14714 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSPNQ14714 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SSPNQ14714 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSPNQ14714 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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