Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN5AQ14524 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN5AQ14524 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN5AQ14524 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN5AQ14524 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN5AQ14524 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN5AQ14524 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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