Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGB3BPQ13352 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGB3BPQ13352 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB3BPQ13352 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
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