Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 NUP214-213ENST00000525384 840 ntTSL 1 (best)6.56□□□□□ -1.368e-13■■■■■ 32.6
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ILF3Q12906 NUP214-212ENST00000524578 524 ntTSL 31.7□□□□□ -2.148e-13■■■■■ 32.6
ILF3Q12906 KTN1-215ENST00000554567 730 ntTSL 526.54■■□□□ 1.848e-8■■■■■ 32.5
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ILF3Q12906 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.628e-8■■■■■ 32.5
ILF3Q12906 KTN1-225ENST00000557267 291 ntTSL 34.14□□□□□ -1.758e-8■■■■■ 32.5
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ILF3Q12906 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.18e-8■■■■■ 32.5
ILF3Q12906 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.228e-8■■■■■ 32.5
ILF3Q12906 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 32.5
ILF3Q12906 PGK1-205ENST00000491291 702 ntTSL 58.79□□□□□ -12e-8■■■■■ 32.5
ILF3Q12906 Z68871.1-201ENST00000426528 1133 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.065e-9■■■■■ 32.5
ILF3Q12906 URI1-209ENST00000574666 844 ntTSL 523.29■■□□□ 1.321e-9■■■■■ 32.4
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ILF3Q12906 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.271e-9■■■■■ 32.4
ILF3Q12906 URI1-208ENST00000574233 486 ntTSL 35.57□□□□□ -1.521e-9■■■■■ 32.4
ILF3Q12906 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.521e-9■■■■■ 32.4
ILF3Q12906 URI1-212ENST00000576442 578 ntTSL 42.87□□□□□ -1.951e-9■■■■■ 32.4
ILF3Q12906 URI1-204ENST00000570704 559 ntTSL 42.67□□□□□ -1.981e-9■■■■■ 32.4
ILF3Q12906 PRPF40A-204ENST00000450303 496 ntTSL 316.88■□□□□ 0.296e-10■■■■■ 32.4
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ILF3Q12906 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 32.4
ILF3Q12906 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 32.4
ILF3Q12906 DGUOK-203ENST00000418996 703 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 32.4
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ILF3Q12906 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.283e-7■■■■■ 32.4
ILF3Q12906 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 32.4
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ILF3Q12906 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.21e-9■■■■■ 32.3
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ILF3Q12906 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-9■■■■■ 32.3
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ILF3Q12906 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.231e-9■■■■■ 32.3
ILF3Q12906 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.41e-9■■■■■ 32.3
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ILF3Q12906 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.781e-9■■■■■ 32.3
ILF3Q12906 SHCBP1-202ENST00000563219 485 ntTSL 33.14□□□□□ -1.911e-9■■■■■ 32.3
ILF3Q12906 ZNF43-203ENST00000593551 474 ntTSL 42.39□□□□□ -2.031e-9■■■■■ 32.3
ILF3Q12906 SPATS2-220ENST00000552557 727 ntTSL 33.95□□□□□ -1.785e-8■■■■■ 32.3
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ILF3Q12906 ANPEP-201ENST00000300060 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 32
ILF3Q12906 SAR1A-203ENST00000373239 468 ntTSL 313.93□□□□□ -0.186e-14■■■■■ 32
ILF3Q12906 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.296e-14■■■■■ 32
ILF3Q12906 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.846e-14■■■■■ 32
ILF3Q12906 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.146e-14■■■■■ 32
ILF3Q12906 STRN3-203ENST00000366206 575 ntTSL 410.93□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 31.9
ILF3Q12906 STRN3-205ENST00000554991 417 ntTSL 58.52□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 31.9
ILF3Q12906 STRN3-208ENST00000556577 514 ntTSL 57.59□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 31.9
ILF3Q12906 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 31.9
ILF3Q12906 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 31.9
ILF3Q12906 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 31.9
ILF3Q12906 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 31.9
ILF3Q12906 CDC42BPA-209ENST00000448940 7355 ntTSL 1 (best)5.79□□□□□ -1.483e-7■■■■■ 31.9
ILF3Q12906 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.593e-7■■■■■ 31.9
ILF3Q12906 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 31.8
ILF3Q12906 SOX5-204ENST00000441133 638 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 31.7
ILF3Q12906 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.953e-10■■■■■ 31.7
ILF3Q12906 SOX5-212ENST00000541536 2365 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.993e-10■■■■■ 31.7
ILF3Q12906 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.023e-10■■■■■ 31.7
ILF3Q12906 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.073e-10■■■■■ 31.7
ILF3Q12906 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.193e-10■■■■■ 31.7
ILF3Q12906 SOX5-201ENST00000367206 1816 ntTSL 26.53□□□□□ -1.363e-10■■■■■ 31.7
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