Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN1Q12860 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN1Q12860 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNTN1Q12860 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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