Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GABPAQ06546 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GABPAQ06546 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GABPAQ06546 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms