Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRB3Q04118 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRB3Q04118 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRB3Q04118 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PRB3Q04118 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRB3Q04118 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms