Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP4A11Q02928 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP4A11Q02928 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYP4A11Q02928 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP4A11Q02928 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP4A11Q02928 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms