Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRG1Q02297 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NRG1Q02297 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRG1Q02297 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRG1Q02297 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRG1Q02297 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NRG1Q02297 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRG1Q02297 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRG1Q02297 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRG1Q02297 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NRG1Q02297 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRG1Q02297 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRG1Q02297 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRG1Q02297 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRG1Q02297 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRG1Q02297 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRG1Q02297 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NRG1Q02297 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRG1Q02297 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRG1Q02297 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRG1Q02297 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRG1Q02297 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRG1Q02297 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRG1Q02297 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRG1Q02297 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms