Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SATB1Q01826 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SATB1Q01826 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SATB1Q01826 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SATB1Q01826 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SATB1Q01826 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SATB1Q01826 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms